Nebo-li všude, kde je potřeba něco elektronicky podepisovat. V HTML5 sice nejspíš brzy půjde napsat program pro střih 3D videa, ale podpora pro elektronický podpis nebo šifrování v prohlížečích není a ani to nevypadá, že by o tom někdo aspoň uvažoval. Takže jediná reálná možnost, jak z prohlížeče něco elektronicky podepsat, je stále jen Java.
Minimálně v jednom prohlížeči podpora pro šifrování/elektronický podpis už delší dobu je a standard window.crypto se na půdě W3C aktivně připravuje:
https://developer.mozilla.org/en-US/docs/JavaScript_crypto
http://www.w3.org/2012/webcrypto/WebCryptoAPI/