Rozsáhlé spisy ani pomocí ISDS jít nemohou, "pokud to povaha dokumentu" umožňuje se na ně nevztahuje, protože limit DS jako takové je 10MB, což naskenovaný spis bude mít málokdy.
Ale i u státních institucí se vyskytují problémy s datovými schránkami. „Počet orgánů veřejné správy, které mají datovou schránku aktivovánu, je poměrně malý. Pořád se vedou diskuse o tom, kdo ji vlastně musí využívat a kdo ne. Největší problémy jsou zřejmě na ministerstvu spravedlnosti, které zrušilo výběrové řízení na spisové služby,“ řekl novinářům ministr Pecina. Je ale přesvědčen, že všechny instituce včetně soudů budou datové schránky od 1. listopadu využívat.
„Například u zmiňovaných soudů se to ale bude po nějakou přechodnou dobu dělat ručně. Do datové schránky soudu tedy přijde zpráva, kterou zatím systém nepředá konečnému adresátovi, ale v podatelně ji vytisknou a doručí adresátovi stejně jako v případě klasických poštovních obálek,“ vysvětlil Pecina. Rozsáhlé soudní spisy budou soudy zřejmě i po zavedení datových schránek posílat poštou. Jejich skenování u jednoho soudu a tisk a následná autorizace vytištěných stránek u druhého soudu by podle něj byla příliš nákladná.