Takové věci jako evidence EET „v zastoupení“ Slevomatem/platební bránou/whatever naráží ještě na jeden provlém: podle zákona jste povinni „zacházet s autentizačními údaji a certifikátem pro evidenci tržeb tak, aby nemohlo dojít k jejich zneužití“. Podle metodiky se této odpovědnosti nelze zbavit například tím, že byste s tím, kdo za vás EET eviduje, uzavřeli třeba smlouvu o důvěrnosti (kapitola 2.4.1.4).
U eshopů je s tím taky problém a v podstatě to nejde splnit, když si uvědomíte, kolik děr se v nich neustále nachází (ať už je to PHP, ve kterém jsou skoro všechny napsané, nebo OpenSSL, které se k podepisování opět skoro všude používá. Oba tyto projekty jsou známé neuvěřitelným množstvím děr.).